L'estació de Núria és el punt culminant de la línia. Està a 1964 metres d'alçada, al km 12,491. Té tres vies, la general i dues de desviades. Tant la via general com la desviada a la dreta són de una longitud considerable (vies 1 i 2) amb andanes laterals, ja que a la part final de la línia és on s'hi estacionen els vagons de mercaderies per a la seva càrrega i descàrrega. Justament entre les vies 1 i 2 hi ha una diagonal per tal de facilitar maniobres. Finalment, la tercera via desviada és a l'esquerra i és d'una longitud inferior, compartint andana amb la via 1, la general. L'edifici de viatgers està situat a l'esquerra de les vies, just darrere el topall de la via 3. És de dues plantes i acull una gran sala d'espera i uns lavabos. No disposa de taquilla ja que els bitllets cal adquirir-los a un punt d'informació central del santuari. El pas entre andanes es realitza per dos passos a nivell i són força frequentats ja que just a la dreta de les vies hi ha l'edifici de l'estació inferior del Telecabina de la Coma del Clot.