Sant Boi de Llobregat és una estació que va posar-se en servei l'any 1912 amb la obertura de la línia de Barcelona a Martorell. Avui dia l'estació compta amb tres vies (numerades 1,2 i 6, ja que fins no fa gaire temps hi havia una altra via més que estava numerada com a via 4) i dues andanes amb marquesines metàl·liques d'un dels tipus unificat a FGC. Hi ha una altra andana que serveix a la via 6 que no es sol usar, i en la qual també hi ha el bar de l'estació. L'antic edifici de viatgers està destinat a acollir el centre de control centralitzat de trànsit (CTC) de la línia Llobregat-Anoia. Així doncs, l'accés a les andanes i la venda de bitllets es realitza a través d'un vestíbul que hi ha sota les vies, en el qual s'hi troben les màquines de venda de bitllets (MAEs) i diverses portes de control d'accés a les andanes. Per pujar a les andanes hi ha escales, escales automàtiques i ascensors, de manera que l'estació queda adaptada a PMR. Hi ha un edifici a part que serveix per enllaçar directament l'aparcament de vehicles (park&ride) amb l'andana de la via 1, en el qual també hi ha MAEs i portes de control d'accés. Completen les instal·lacions sortint de l'estació direcció Martorell una llarga via morta amb entrada pel costat Molí Nou, una zona per a estacionament de trens formada per quatre vies mortes que apunten direcció Barcelona i una sots-central elèctrica a la qual hi arriba una via sense electrificar des d'una de les vies generals.